MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH02

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015661	TCC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015661	CTC	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015661	A	6	6	1703	1708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015661	ACACC	2	10	1710	1719	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_015661	TTA	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015661	ATAA	2	8	1808	1815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015661	TTCC	2	8	1851	1858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015661	A	6	6	1868	1873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015661	C	6	6	1903	1908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_015661	A	7	7	1930	1936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015661	T	6	6	1937	1942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015661	AAC	2	6	1964	1969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015661	T	7	7	1988	1994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015661	GGA	2	6	1999	2004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015661	GTCT	2	8	2024	2031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015661	CGAA	2	8	2034	2041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015661	ACA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015661	CAC	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015661	TCC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015661	CTT	2	6	2164	2169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015661	AC	4	8	2189	2196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015661	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015661	CA	3	6	2234	2239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015661	A	7	7	2285	2291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015661	TC	3	6	2298	2303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015661	ACA	2	6	2304	2309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015661	CT	3	6	2322	2327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015661	C	6	6	2338	2343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_015661	TCCA	2	8	2364	2371	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015661	ATT	2	6	2399	2404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015661	A	7	7	2440	2446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015661	T	6	6	2553	2558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015661	AT	3	6	2628	2633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015661	CAA	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015661	TAT	2	6	4052	4057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015661	GTG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015661	GGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015661	TG	3	6	4108	4113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015661	T	6	6	4133	4138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015661	TC	3	6	4143	4148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015661	TCTG	2	8	4151	4158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015661	AAG	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015661	TAAT	2	8	4253	4260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015661	T	7	7	4268	4274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015661	TGC	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015661	T	6	6	5019	5024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015661	T	7	7	5042	5048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015661	ATT	2	6	5061	5066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015661	TAT	2	6	5073	5078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015661	T	6	6	5081	5086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015661	AT	3	6	5091	5096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015661	GAAGG	2	10	5151	5160	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015661	TCC	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015661	T	7	7	5441	5447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015661	GAT	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015661	A	7	7	5552	5558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015661	TTTTA	2	10	5582	5591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015661	GTA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015661	GAT	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015661	TGAT	2	8	5863	5870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015661	TGTA	2	8	5878	5885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015661	AT	3	6	5900	5905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015661	TCT	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015661	A	7	7	6599	6605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015661	GA	3	6	6608	6613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015661	A	7	7	6617	6623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015661	TAA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015661	ATC	5	15	7569	7583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015661	TAT	2	6	7602	7607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015661	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015661	T	7	7	7617	7623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015661	TCA	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015661	CCA	3	9	7701	7709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015661	CAT	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015661	TAT	2	6	8419	8424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015661	CTCA	2	8	8425	8432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015661	TAA	2	6	8450	8455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015661	GCC	2	6	8498	8503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015661	GTT	2	6	8513	8518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015661	ATA	2	6	8648	8653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015661	TTG	2	6	8659	8664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015661	A	7	7	8792	8798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015661	A	6	6	8887	8892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015661	CT	3	6	8897	8902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015661	GCC	2	6	8912	8917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015661	C	6	6	8964	8969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_015661	CCT	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015661	AC	4	8	9059	9066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015661	TAA	2	6	9183	9188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015661	A	6	6	9187	9192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015661	A	6	6	9205	9210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015661	TA	3	6	9226	9231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015661	CCGT	2	8	9271	9278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015661	CCAC	2	8	9279	9286	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_015661	GAT	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015661	CCG	2	6	9342	9347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015661	ACCA	2	8	9404	9411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015661	TCC	2	6	9741	9746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015661	T	6	6	10040	10045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015661	T	7	7	10081	10087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015661	AAAAT	2	10	10097	10106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015661	T	6	6	10122	10127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015661	TAA	2	6	10186	10191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015661	A	6	6	10190	10195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015661	GTT	2	6	10198	10203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015661	CATT	2	8	10261	10268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015661	A	6	6	10271	10276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015661	TGT	2	6	10306	10311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015661	AAT	2	6	10320	10325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015661	CTA	2	6	10327	10332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015661	TAAT	2	8	10333	10340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015661	AGG	2	6	10370	10375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015661	T	6	6	11185	11190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015661	T	6	6	11275	11280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015661	CTGAA	2	10	11294	11303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015661	A	8	8	11302	11309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015661	AGA	2	6	11312	11317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015661	GAA	2	6	11345	11350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015661	CTTT	2	8	11398	11405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015661	AAAGG	2	10	11419	11428	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015661	CAAA	2	8	11447	11454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015661	AAT	2	6	11470	11475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015661	CTC	2	6	11529	11534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015661	T	7	7	11580	11586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015661	AAAAAT	2	12	11595	11606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015661	CGT	2	6	11614	11619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015661	AAAC	2	8	11673	11680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015661	CAG	2	6	11795	11800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015661	A	7	7	11880	11886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015661	CCT	2	6	12101	12106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015661	A	7	7	12184	12190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015661	T	6	6	12214	12219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015661	A	6	6	12220	12225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015661	A	6	6	12263	12268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015661	GAAG	2	8	12280	12287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015661	AGTGAA	2	12	12290	12301	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015661	T	7	7	12304	12310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015661	TC	3	6	12327	12332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015661	TTTC	2	8	12350	12357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015661	TAT	2	6	12360	12365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015661	T	6	6	12378	12383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015661	A	7	7	12388	12394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015661	A	6	6	12400	12405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015661	TATAA	2	10	12415	12424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015661	ATTT	2	8	12430	12437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015661	A	6	6	12606	12611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015661	T	6	6	12628	12633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015661	A	6	6	12649	12654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015661	T	6	6	12660	12665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015661	A	6	6	12694	12699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015661	T	6	6	12729	12734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015661	A	7	7	12846	12852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015661	CAC	2	6	12871	12876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_015661	T	6	6	12886	12891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015661	A	6	6	12892	12897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015661	A	6	6	12901	12906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015661	G	7	7	12917	12923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015661	CG	3	6	12926	12931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_015661	TG	3	6	12937	12942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015661	T	6	6	12943	12948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015661	A	6	6	12975	12980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015661	A	6	6	13080	13085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015661	C	6	6	13092	13097	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
164	NC_015661	CTT	2	6	13101	13106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015661	A	7	7	13126	13132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015661	CG	3	6	13135	13140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_015661	GCC	2	6	13186	13191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_015661	ATTAT	2	10	13198	13207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015661	TCGTT	2	10	13288	13297	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
170	NC_015661	A	6	6	13321	13326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015661	TCA	2	6	14112	14117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_015661	CAA	2	6	14124	14129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_015661	CCT	2	6	19585	19590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_015661	TAA	2	6	19605	19610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015661	ATA	3	9	19618	19626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.